More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4464 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  292  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  93.84 
 
 
146 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  93.84 
 
 
146 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  93.15 
 
 
146 aa  274  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  93.15 
 
 
146 aa  273  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
147 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  52.48 
 
 
147 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
159 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
156 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
154 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
154 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
155 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  35.88 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  39.45 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.11 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  29.93 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  31.54 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  31.01 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  31.01 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.94 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  30.94 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  35.14 
 
 
185 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.62 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.23 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.16 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.23 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.23 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.23 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
164 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>