More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2913 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  294  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 156 aa  93.2  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  38.05 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  33.82 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  36.28 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.36 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  28.15 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.39 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  31.62 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.01 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  29.92 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>