More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1441 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
147 aa  296  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 
157 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
151 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  42.97 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
142 aa  85.9  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  37.98 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.07 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.63 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.63 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 
176 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
167 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  31.78 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  28.95 
 
 
155 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
194 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  31.48 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  28.45 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
174 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  31.5 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>