More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2214 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  42.74 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.71 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.27 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  34.11 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.19 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.36 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  34.44 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  30 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>