More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3382 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  344  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  97.65 
 
 		 170 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 167 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  57.64 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  40.16 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  44.79 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  33.07 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  28.68 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  40.7 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  24.82 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  27.82 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  25.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>