More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3012 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  287  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 
144 aa  277  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 
144 aa  277  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 
144 aa  277  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  95.65 
 
 
138 aa  277  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  95.65 
 
 
138 aa  276  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 
138 aa  276  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  95.65 
 
 
138 aa  276  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  95.65 
 
 
138 aa  276  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  94.93 
 
 
138 aa  276  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  82.73 
 
 
139 aa  247  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
141 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  30.5 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.93 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
171 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.93 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  27.34 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  21.48 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
169 aa  57  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
147 aa  57  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  26.56 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  30.51 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.81 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  28.12 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  25.58 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  21.8 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>