More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0158 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 152 aa  296  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  84 
 
 		 152 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  73.15 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  34.56 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  46.25 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  36.28 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.47 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.08 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  27.34 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.91 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.47 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>