More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3914 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  79.49 
 
 		 169 aa  262  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  75.64 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  73.94 
 
 		 175 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 173 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 168 aa  243  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  73.89 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  45.19 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  33.06 
 
 		 261 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.52 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.52 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.52 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.52 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  28.18 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.34 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.18 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.68 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.18 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.18 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  26.47 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  22 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.68 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.68 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.93 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.93 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.93 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.93 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  28.86 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.45 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>