More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2992 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  88.48 
 
 		 168 aa  294  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  61.33 
 
 		 187 aa  190  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  61.22 
 
 		 158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 158 aa  180  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  54.67 
 
 		 201 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  54 
 
 		 194 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  54 
 
 		 194 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 		 175 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 203 aa  153  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 186 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  39.2 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  39.2 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  29.93 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.39 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  33.05 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  39.45 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  30.17 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.78 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  33.94 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>