More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4103 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  366  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  73.91 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  78 
 
 		 168 aa  251  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  72.15 
 
 		 173 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  72.5 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  73.89 
 
 		 170 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  45.93 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  26.35 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.74 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  24.16 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  31.31 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  28.07 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.09 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.09 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.09 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.3 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.3 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.3 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.3 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.3 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.68 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 146 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  38.67 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  27.62 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.93 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>