132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0247 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  278  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  90.28 
 
 		 147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  44.06 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  48.42 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  46.96 
 
 		 158 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  52.13 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  37.24 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 180 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 179 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  44.12 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.23 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  34.74 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  35.14 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  33.72 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  26.96 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  33.64 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  29.32 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  32.11 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 154 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 157 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 145 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.71 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.05 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>