More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4836 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  270  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  98.56 
 
 
139 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  98.56 
 
 
139 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
139 aa  189  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  67.39 
 
 
159 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  67.39 
 
 
159 aa  185  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
159 aa  183  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
159 aa  183  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
159 aa  183  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
159 aa  183  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  67.69 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  58.21 
 
 
144 aa  150  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  74.39 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  42.06 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5857  MarR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0150711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
347 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
349 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
340 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
326 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
340 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
138 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.11 
 
 
349 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
347 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
309 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.87 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
320 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  36.71 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.5 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  36 
 
 
214 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
146 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 
163 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
180 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
150 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 
150 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  42.11 
 
 
287 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  25.62 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.9 
 
 
283 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  33.64 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.34 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  35.51 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  35.58 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>