35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0862 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  38.17 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  50 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  50.77 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  38.75 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  50.91 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  38.57 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  33.91 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  23.89 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>