228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2086 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 169 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 170 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 187 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  32.54 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  30.95 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 183 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  31.21 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  25.66 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  26.8 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  27.84 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  28.43 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  28.72 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.68 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  28.43 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>