More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0920 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  85.8 
 
 		 177 aa  279  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  71.26 
 
 		 173 aa  246  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  66.46 
 
 		 168 aa  225  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  63.86 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  61.96 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  60.62 
 
 		 162 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  58.13 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  55.62 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  58.9 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  53.12 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  53.7 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  46.91 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  51.25 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  48.47 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  48.75 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.55 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  41.46 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.66 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  30.06 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>