More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5097 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  297  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 156 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 156 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  43.2 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  43.56 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  31.62 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  22.4 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.46 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.69 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 411 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>