154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1106 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  86.05 
 
 		 188 aa  301  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  45.51 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  43.31 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  32.26 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  32.26 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.63 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3512  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  31.82 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.43 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  31.63 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  38.96 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.68 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.68 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.57 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.05 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4547  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  27.21 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  29.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  29.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  29.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  29.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  26.42 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>