36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4547 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4547  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 235 aa  493  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  28.76 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4956  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  21.59 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 160 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 160 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 161 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 161 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 		 166 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 153 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>