More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1959 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  304  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>