More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1081 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1674  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.4 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.63 
 
 
214 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  33.58 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
145 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
203 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  50.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  29.59 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
162 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 
170 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
148 aa  47.8  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>