More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6338 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  59.06 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  43.85 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.61 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  34.78 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 296 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.66 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.66 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  37.37 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.15 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  33.82 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  25.58 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  34.83 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  36.26 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  39.76 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.57 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>