More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5323 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
152 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
182 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
191 aa  58.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.05 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  32.61 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.23 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  30.15 
 
 
287 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.73 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
185 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  33.6 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 
187 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  23.78 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.14 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35.9 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
140 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
159 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  25.74 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
172 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
150 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
150 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>