More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06409 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  60.74 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 168 aa  153  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 139 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.3 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.26 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  34.31 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  34.31 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>