169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0396 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  41.09 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  47.87 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.53 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 220 aa  50.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 325 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  23.97 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 326 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 326 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  21.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  21.15 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.67 
 
 		 310 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 143 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>