67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2550 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
152 aa  315  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 
153 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 
153 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 
157 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  49.06 
 
 
155 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
157 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  27.42 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  32.56 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  26.13 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  22.7 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  24.79 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  20.98 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  25.29 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
139 aa  43.9  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  20.22 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 
157 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
149 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  25.53 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>