46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0497 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  306  8e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
156 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 
220 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  27.83 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  25.84 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  26.53 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  29.82 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  23.86 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  21.11 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  23.86 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  22.81 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  20.22 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  24.72 
 
 
157 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
120 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 
159 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  21.11 
 
 
139 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  21.59 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0530  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
226 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000301669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  23.81 
 
 
161 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>