272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2149 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
201 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  27.97 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
309 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  27.97 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.37 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  27.03 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  27.52 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  28.07 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
308 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
307 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
310 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
152 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
157 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
201 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
169 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  24.09 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.83 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  28.42 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  34.78 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  29.47 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  29.63 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  31.01 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  21.95 
 
 
148 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
142 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  33.7 
 
 
161 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
145 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
151 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.19 
 
 
312 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  26.67 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>