159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2339 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.19 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.19 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.41 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.86 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 326 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 340 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 340 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.09 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 309 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  30.53 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 347 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.37 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.85 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  26.28 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  33.72 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  35.96 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  31.88 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  35.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  20.87 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.62 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  40.54 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1554  regulatory protein MarR  30.59 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  25.74 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  44.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  44.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  44.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  44.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>