50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1554 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1554  regulatory protein MarR  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  34.59 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  28.75 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  28.89 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.75 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  21.8 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  21.05 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  20.49 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 146 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  26.27 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>