More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6744 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  46.31 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  46.22 
 
 		 189 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  34.97 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  38 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.52 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.67 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.15 
 
 		 326 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.43 
 
 		 312 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.57 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35.58 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.81 
 
 		 287 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.51 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 310 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.96 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>