More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1302 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 142 aa  281  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  95.07 
 
 		 142 aa  269  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  42.73 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  37.88 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  34.51 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  38.6 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  32.43 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  39.19 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.05 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 190 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.81 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  38 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>