More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3659 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  313  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 205 aa  213  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  34.21 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  35.4 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  37.11 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  33.77 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.82 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  43.04 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  33.63 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.93 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.07 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35.48 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.78 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.63 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  30.95 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.12 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 411 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>