244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2534 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  40.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  38.46 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 165 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.58 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  53.19 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.45 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  36.84 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  40.85 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.93 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>