More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3651 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 168 aa  291  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 173 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  57.67 
 
 		 170 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  57.32 
 
 		 167 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  57.67 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  57.86 
 
 		 165 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  54.66 
 
 		 178 aa  161  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  52.41 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  53.66 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  54.27 
 
 		 166 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  54.44 
 
 		 179 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  51.79 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  56.79 
 
 		 162 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  51.19 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  51.2 
 
 		 170 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  51.53 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  53.66 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  51.16 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 136 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 172 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 147 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 163 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 158 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 143 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.93 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>