More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  76.69 
 
 
167 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  70.62 
 
 
170 aa  237  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  51.23 
 
 
174 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  53.12 
 
 
177 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  53.12 
 
 
168 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
181 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  51.23 
 
 
177 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  51.88 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  54.37 
 
 
162 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
173 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  49.38 
 
 
173 aa  157  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  49.69 
 
 
179 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  49.4 
 
 
170 aa  152  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 
168 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  51.53 
 
 
207 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  47.59 
 
 
185 aa  140  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
180 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  45.68 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  48.12 
 
 
165 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
167 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  46.71 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  33.13 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  36.43 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
191 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.97 
 
 
149 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
139 aa  57.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
149 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.87 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
233 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.09 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  34.25 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>