More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0121 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  342  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  73.65 
 
 
161 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  63.33 
 
 
233 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  59.6 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  46.73 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  45.54 
 
 
175 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
163 aa  94  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 
153 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  40.71 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 
157 aa  87.8  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
160 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  36.6 
 
 
166 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
159 aa  84.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  44.57 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  43 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  39.42 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  35.29 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  36.22 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  52.05 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  36.8 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  40.57 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  33.03 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  35.77 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  44.87 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 
128 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  35.07 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  32.48 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  37.3 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  37.3 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  37.3 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  39 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>