More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3221 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  300  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  39.52 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  34.75 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  32.64 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  32.61 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  39.36 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  34.23 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  37.86 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.83 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.83 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.83 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.06 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  33.83 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  33.83 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  33.58 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  31 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.58 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  31.58 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  33.58 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>