More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7275 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  287  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  47.31 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  42.17 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  39.53 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  42.05 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  39.53 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  32.59 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.85 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>