More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1150 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 168 aa  339  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  32.23 
 
 		 324 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.11 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.36 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  30.28 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  27.69 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  26.15 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  26.36 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  27.69 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  26.36 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  31.19 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.04 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  37.96 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.11 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.29 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  23.2 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>