More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0158 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  281  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  57.02 
 
 		 324 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  43.96 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  32.77 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  36.11 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  41.77 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.55 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.73 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  32.43 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 		 162 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  36.96 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  31.73 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.46 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>