More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2289 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  295  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.71 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  28.83 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  29.37 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.2 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.46 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  27.82 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  23.33 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  27.48 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  23.08 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  23.08 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>