More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1655 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
155 aa  319  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.12 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  35.24 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.81 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.81 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.1 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  28.91 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.6 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.82 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.56 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  28.24 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  26.09 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30.37 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.1 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.1 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.1 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.1 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.1 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  26.28 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.84 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  26.09 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.26 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  26.28 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.84 
 
 
312 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  27.54 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  27.54 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>