More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0409 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  57.05 
 
 		 165 aa  190  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  33.87 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.3 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  28 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.77 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  31.73 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  28.35 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  37.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  37.08 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.11 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  20.77 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  28.78 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>