236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0353 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  100 
 
 		 168 aa  348  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  43.02 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  24.53 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  24.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  24.83 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.22 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  32.14 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  32.14 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  22.3 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  22.64 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>