292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2998 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  25 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  31.9 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  25.19 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 349 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.38 
 
 		 349 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 347 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.36 
 
 		 304 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  26.36 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  28.7 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  27.18 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  28.7 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.59 
 
 		 312 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  48.08 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 326 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 340 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.1 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 340 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>