204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2052 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 149 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 149 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.81 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  25.75 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  25.68 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  28.86 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  22 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  20.15 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  20.69 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  24.63 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 303 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>