82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0978 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.46 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.69 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  33.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  24.83 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03120  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.489584  hitchhiker  0.0000000819923 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25.53 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.36 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  26.06 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  29.91 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 156 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  25.6 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3318  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  22.64 
 
 		 136 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>