127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1793 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  329  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  81.88 
 
 
160 aa  277  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  81.88 
 
 
160 aa  277  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  81.88 
 
 
160 aa  275  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 
158 aa  274  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  81.25 
 
 
160 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  80.62 
 
 
160 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  80.62 
 
 
160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  80.62 
 
 
160 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  80.62 
 
 
160 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  80.62 
 
 
160 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  49.25 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
158 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
148 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
157 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
151 aa  121  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  48.48 
 
 
151 aa  121  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 
167 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 
167 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
147 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  41.67 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  38.81 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
170 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
169 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
169 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
179 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 
187 aa  94  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 
191 aa  94  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
172 aa  94  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  42.42 
 
 
191 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
181 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  42.72 
 
 
184 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
226 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
174 aa  90.5  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
187 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  40.37 
 
 
154 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
179 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
237 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
186 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
169 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
183 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
153 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  25 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 
203 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.02 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.37 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  22.76 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  22.76 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
160 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25.2 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
173 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
201 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>