More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2337 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  333  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  36.91 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  35.57 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  35.53 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  33.97 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  84.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  31.51 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  31.41 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  24.66 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  26.49 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  23.31 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  26.71 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.52 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  23.84 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  23.87 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>