161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3392 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  52.59 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  44.86 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  41.67 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 185 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  38.69 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 304 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 316 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.09 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  23.28 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1846  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  21.95 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  27.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>